MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG1

Total Repeats: 884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017766	GC	3	6	1	6	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017766	GACGC	2	10	20	29	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017766	GCC	2	6	30	35	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017766	CGG	2	6	42	47	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017766	CGG	2	6	120	125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017766	CGCC	2	8	192	199	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_017766	AGC	3	9	203	211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017766	CGCT	2	8	258	265	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017766	CCG	2	6	266	271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017766	CAA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017766	C	8	8	311	318	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_017766	GAC	2	6	351	356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017766	GCAC	2	8	410	417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017766	CTC	2	6	429	434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017766	GGA	2	6	449	454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017766	TGA	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017766	CG	4	8	3155	3162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017766	CG	3	6	3173	3178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017766	CAA	2	6	3182	3187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017766	ACCCC	2	10	3196	3205	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
21	NC_017766	TCCC	2	8	3234	3241	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_017766	CTT	3	9	3247	3255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017766	CTGG	2	8	3257	3264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017766	TGA	2	6	3323	3328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017766	GCG	2	6	3628	3633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017766	CGC	2	6	3687	3692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017766	GC	3	6	3718	3723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017766	CGC	3	9	4994	5002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017766	CGG	2	6	5015	5020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017766	GCG	3	9	5026	5034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017766	CGG	2	6	5052	5057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017766	ACCC	2	8	6349	6356	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_017766	GCC	2	6	6365	6370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017766	CCG	2	6	6392	6397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017766	GAT	2	6	6652	6657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017766	GCC	2	6	6669	6674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017766	CGC	2	6	6718	6723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017766	CGTC	2	8	6754	6761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017766	CGC	2	6	6811	6816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017766	GCC	2	6	6817	6822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017766	ACG	2	6	6829	6834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017766	TCT	2	6	6950	6955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017766	TCAC	2	8	6982	6989	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017766	CGG	2	6	8699	8704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017766	AAG	2	6	8811	8816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017766	GGC	2	6	9028	9033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017766	G	6	6	9038	9043	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017766	TC	3	6	9051	9056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017766	GCC	2	6	9060	9065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017766	GCC	2	6	9109	9114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017766	GGC	2	6	9123	9128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017766	CGG	2	6	9163	9168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017766	TCG	2	6	9169	9174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017766	GGC	2	6	9704	9709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017766	GCC	2	6	9721	9726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017766	GGC	3	9	9730	9738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017766	GGGC	2	8	9743	9750	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017766	GCGGG	2	10	9752	9761	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017766	TCGA	2	8	9783	9790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017766	CACGG	2	10	10956	10965	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017766	CTG	2	6	11317	11322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017766	CGGGC	2	10	11323	11332	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017766	CCCG	2	8	11819	11826	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_017766	CGA	2	6	11832	11837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017766	CGGCC	2	10	11906	11915	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_017766	CCA	2	6	11920	11925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017766	CACCG	2	10	11953	11962	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_017766	CCAC	2	8	11973	11980	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_017766	CAG	2	6	12022	12027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017766	CTG	2	6	12060	12065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017766	GCC	2	6	12086	12091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017766	ACT	2	6	14124	14129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017766	TG	4	8	14143	14150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017766	CGCTCA	2	12	14156	14167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017766	CCG	2	6	14204	14209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017766	GCTT	2	8	14229	14236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017766	CG	4	8	14246	14253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017766	CGG	2	6	14262	14267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017766	CGCC	2	8	14281	14288	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_017766	CCCA	2	8	14301	14308	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_017766	CAC	2	6	14325	14330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017766	CAG	2	6	14332	14337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017766	CGC	2	6	14348	14353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017766	CAA	2	6	14361	14366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017766	GT	3	6	15730	15735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017766	CCT	2	6	15844	15849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017766	CTG	2	6	15927	15932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017766	TCGC	2	8	16480	16487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017766	GTCCAG	2	12	16519	16530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017766	GTG	2	6	16552	16557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017766	AGC	2	6	16604	16609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017766	CCGG	2	8	16611	16618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017766	GCC	2	6	16623	16628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017766	GGGT	2	8	16640	16647	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017766	TGC	2	6	16670	16675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017766	GAGCT	2	10	16702	16711	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017766	GTG	2	6	16717	16722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017766	GCGG	2	8	16739	16746	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017766	CTG	2	6	16757	16762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017766	TGC	2	6	16860	16865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017766	GC	3	6	16883	16888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017766	ACCA	2	8	16913	16920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017766	C	6	6	16984	16989	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_017766	CGG	3	9	16996	17004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017766	CTTC	2	8	17051	17058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017766	TAAGC	2	10	18186	18195	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017766	AG	3	6	18274	18279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017766	GTGGG	2	10	18292	18301	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017766	GGT	3	9	18320	18328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017766	AGC	2	6	18340	18345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017766	GCC	2	6	18422	18427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017766	GGCA	2	8	18784	18791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017766	CAG	2	6	18793	18798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017766	GCA	2	6	18843	18848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017766	CGA	2	6	18874	18879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017766	AGC	3	9	18895	18903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017766	CG	3	6	19132	19137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017766	GCT	2	6	19165	19170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017766	ACG	2	6	19207	19212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017766	CG	3	6	19218	19223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017766	GTT	2	6	19556	19561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017766	AGC	2	6	19562	19567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017766	CGG	2	6	19571	19576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017766	TG	3	6	20290	20295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017766	CGG	2	6	20957	20962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017766	GCT	2	6	21049	21054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017766	CGTCGG	2	12	21105	21116	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017766	GCG	2	6	21159	21164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017766	GTT	2	6	21187	21192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017766	GC	3	6	21212	21217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017766	GAC	2	6	21273	21278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017766	TG	3	6	21300	21305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017766	GAA	2	6	21309	21314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017766	GGC	2	6	21387	21392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017766	CGC	2	6	21398	21403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017766	CGAC	2	8	23117	23124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017766	CGT	2	6	23132	23137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017766	CAG	2	6	23143	23148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017766	GTC	2	6	23149	23154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017766	AGG	2	6	23163	23168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017766	AAC	2	6	23179	23184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017766	ATC	2	6	23185	23190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017766	CGT	2	6	23196	23201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017766	CG	4	8	23238	23245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017766	CAG	2	6	23322	23327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017766	CCCT	2	8	23521	23528	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
147	NC_017766	CGG	2	6	23552	23557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017766	CGA	2	6	23573	23578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017766	CGC	2	6	23612	23617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_017766	GCCG	2	8	23628	23635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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152	NC_017766	C	6	6	23854	23859	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
153	NC_017766	GGC	2	6	23929	23934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_017766	CGGA	2	8	32616	32623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
192	NC_017766	GCC	2	6	32628	32633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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